而另一方面，荷鲁斯以帝皇子嗣的身份与第二军团的老战士们交好，并很快运用强大的力量与人格魅力折服了包括马歇尔在内的很多老战士。
而面对马歇尔的困境，荷鲁斯则是提出了一个解决方案：主动分裂军团，让每个派系自由发挥，用实际情况来证明究竟哪一个才是最好的。
最终，马歇尔被原体说动了，也正是在这个时候，一个叫尼采的第二军团战士团结了一大批新锐士兵，要求举行新一届【会议】，马歇尔最终决定，两件事情在这一次同时处理。
在一个叫太阳之死的星系，第二军团新一届的【会议】举行了。
而尼采的发言震惊了所有人。
这位战士在发言中抨击了帝皇：他宣称军团的困境都是帝皇所为，人类之主显然在暗中助长军团的内部分裂，而一路上遭遇的无数强敌与补给困难也是帝皇的暗中软刀子。
尼采宣称，人类之主的目的非常的明显，就是要让第二军团成为他手中那条半死不活的饿狼：无论是接下来得到了帮助凤凰涅盘，还是没有援助渐渐消亡，这两种命运如今都被帝皇紧握在手里，且都是合理到让任何人无话可说的。
半死不活，这就是帝皇所渴望的第二军团的状态，伴随着大远征走上正轨，越来越多的原体回归，所有军团的力量也不断的膨胀，人类之主已经不再那么依赖于第二军团的力量了。
但即便如此，尼采却无法解释一点：那就是帝皇为什么要这么做，他为什么要针对第二军团。
由于无法自圆其说，同时，以马歇尔为首的老战士对帝皇的敬仰不可撼动，尼采最终被判为有罪，他和他最坚定的支持者通通被处以流放之刑，这支【失落舰队】就此离开了第二军团的主力，向着银河东北部前进。
【失落舰队】具体有多少阿斯塔特还是一个未知数，但是在它离开后，马歇尔不得不紧急征兵，包括赫克特在内的一批新兵就是这个时候入伍的。
此时，第二军团的人数只有一万到一万五千人左右，而同样在此时，大远征已经开始了五十多年，阿斯塔特战士的总人数已经达到了六七十万人。
【失落舰队】是第一批向帝国汇报冉丹异形二次入侵的帝国军队之一，而尼采本人则是在一次与冉丹的遭遇战中阵亡，但他的追随者们拒绝了回归的命令，他们选出了新的领袖，开始在帝国的边缘区域不断地战斗与探索。
而接下来的会议中，马歇尔试图弥合军团的最后努力也失败了，他不得不拆分了军团，公平的分成了几个舰队，同时向他们下达了三条命令：
一，竭尽全力的完成帝国与帝皇发布的命令，证明第二军团的忠诚与价值。
二，竭尽全力的扩大自身，招募新的士兵与战士，保证军团的存续。
三，尽可能的寻找到原体，因为只有原体的力量与地位能够解决军团的问题。
最终，这个曾经辉煌的军团迎来了自己的分裂，马歇尔率领着军团的主要力量与秘密武器库跟随在荷鲁斯的身边，而分散出来的舰队们则是奔赴了各个战场，其中有一支开往了银河东北部，那里正爆发着全银河最惨烈的战争。
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